Uzroke nesreće je odron kamenja, koji se dogodio iza 14 sati, kada je redovna ophodnja prošla tim djelom pruge. Ministar Kalmeta kaže da je "nakon nesreće učinjeno sve što je zakonom bilo predviđeno"
U teškoj željezničkoj nesreći ispred tunela Kupjak u četvrtak navečer strojovođa D. D. (44) iz Rijeke je poginuo, a njegov pomoćnik M.O. (23) iz Vinkovaca je lakše ozlijeđen i zbrinut u bolnici na Sušaku. Mladom Vinkovčaninu koji tek dva i pol mjeseca radi na željeznici slomljena je jagodična kost. Predsjednik Uprave HŽ Holdinga Zlatko Rogožar je na konferenciji za novinare izjavio da su potpuno uništeni lokomotiva i jedan od 17 vagona kompozicije.
Uzrok nesreće je odron kamenja, a o uzroku i svim okolnostima nesreće izvijestit će istražno povjerenstvo u roku od 30 dana. Predsjednik Uprave HŽ Infrastrukture Branko Jerneić najavio je da bi u petak u večernjim satima ili u noći na subotu pruga mogla biti osposobljena za promet. Prije puštanja u promet provest će se sve zaštitne mjere pruge, tunela i odrona. U petak do 13 sati 13 je vagona bilo pomaknuto, a kada svi budu pomaknuti sanirat će se mjesto događaja.
Jerneić je izjavio i da se ophodnje prugom rade dnevno, da su obavljene i 6. i 7. travnja te da je zadnja redovna dnevna ophodnja prošla mjestom nesreće u četvrtak u 14 sati. Kapitalni remont te pruge završen je 6. srpnja 2009. godine nakon 13 mjeseci rada, a HŽ Infrastruktura preuzela je prugu 27. srpnja 2009. godine. Direktor HŽ Vuče vlakova Oliver Krilić ustvrdio je kako Vuča vlakova maksimlano radi na pomoći obitelji poginulog strojovođe. Predsjednik uprave HŽ Infrastrukture kazao je i da je za usluge održavanja pruge ove godine predviđeno 125 milijuna kuna i za nabavku materijala 100 do 110 milijuna kuna što je na razini prijašnjih godina. Za investicije u željezničku infrastrukturu predviđeno je 1,03 milijarde kuna. Čelnici HŽ-a izrazili su sućut obitelji poginulog strojovođe, zaželjeli brzi oporavak njegovu pomoćniku, a putnicima koji se od Delnica do Skrada prevozi autobusima što izaziva kašnjenja od 15 minuta do pola sata, su se ispričali.