Foto Pixabay.com
Mikrobiološka inteligencija mora biti integralna komponenta precizne medicine. Točna, rana diferencijalna dijagnostika zaraznih bolesti i poznavanje profila osjetljivosti na lijekove smanjit će smrtnost, morbiditet i troškove zdravstvene zaštite.
Znanstvenici su napravili ogroman korak u unaprijeđenju testiranja bakterija razvivši novu platformu koja može testirati svaku vrstu ljudske patogene bakterije poznate čovjeku. Trenutno najbolji sustavi mogu testirati maksimalno do 19 vrsti istovremeno, a ovaj je uređaj osjetljiv na svih 307 poznatih bakterijskih infekcija.
Prema nedavno objavljenom istraživanju, nova platforma može istovremeno pretraživati sojeve bakterija, kao i markere za virulenciju i otpornost na antibiotike.
Ovaj uzbudljiv novi alat, koji se zove “BacCapSeq” platforma, razvili su istraživači iz Centra za infekcije i imunitet s Fakulteta javnog zdravstva pri Sveučilištu Columbia u SAD-u.
– Nakon odobrenja za kliničku upotrebu, BacCapSeq liječnicima će dati snažan alat za brzu i preciznu provjeru svih poznatih patogenih bakterija, uključujući i one koje uzrokuju sepsu, treći vodeći uzrok smrti u Sjedinjenim Državama. Ova je platforma 1000 puta osjetljivija od tradicionalnih nepristranih testiranja, na razini usporediva s testiranjima koja prikazuju svaku bakteriju pojedinačno, objasnio je prvi autor studije Orchid M. Allicock u priopćenju na stranici fakulteta.
Trenutno, najučestalija metoda za testiranje sepse može trajati tri dana, a katkad i duže da bi se dobile informacije o otpornosti na antibiotike. Dok liječnici čekaju na rezultate, obično prepisuju antibiotike širokog spektra, što je praksa koja pridonosi povećanju otpornosti. BacCapSeq osigurava rezultate u roku 70 sati, no istraživači vjeruju da će platforma postati brža s napretkom računalne snage.
Svake godine otpornost na antibiotike zahvaća oko 700 000 ljudi na globalnoj razini.
Kako uređaj funkcionira
BacCapSeq sadrži 4,2 milijuna genetički sondi koje se koriste za detektiranje DNA svih 307 patogenih bakterija, kao i biomarkere za antibiotičku otpornost i virulenciju. Svaka se sonda veže na odgovarajuću sekvencu. Kada je u uzorku prisutna određena bakterija ili biomarker, magnetski proces “izvlači” njegove jedinstvene sekvence koje se potom mogu koristiti za identifikaciju bakterija i njihovih karakteristika.
Do danas, čak i najrazvijeniji sustavi bili su u stanju prepoznati do 19 patogenih bakterija istovremeno, a nalazi dosad nisu bili u stanju procijeniti virulenciju i antimikrobnu otpornosti.
Učinak nove platforme procijenio se na nekoliko načina: pomoću nukleinske kiseline iz krvi s DNK iz nekoliko različitih bakterija, krvi s bakterijskim stanicama, uzorcima krvne kulture i uzorcima krvi iz bolesnika s neobjašnjivom sepsom.
